(一)综合科。负责单位日常运转和综合协调;负责机关文电、政务信息、政务公开、督查督办、机要保密、平安建设、会务保障、印鉴档案和车辆管理等工作;统筹建议、提案的办理回复工作;负责对外(内)检查指导相关服务保障工作;负责单位日常网络维护与安全管理;负责机房和相关设备的维护与管理;负责智慧公共卫生系统管理;负责疾病综合管理信息系统、全民健康保障信息系统的网络维护工作。负责日常运行保障及维护;负责基础设备设施的使用及维护;负责办公用品及应急物资等的采购和维护;负责固定资产的调配及维护;负责爱国卫生相关工作。

(二)组织宣传科。负责中心党总支“三重一大”、中心组理论学习、领导班子建设;负责基层党建、纪检监察、信访稳定、党风廉政、意识形态等工作;负责中心人事管理、机构编制、干部队伍建设、表彰奖励、教育培训和退休干部服务管理等工作;承担中层干部选任、考核;负责职工年度考核、工资晋级、专业技术人员的职称晋升考评;负责人员招聘和人事档案管理;负责对单位人员及与合作单位(人员)发表论文的审核、备案;负责实习生的接收与实习工作安排;承担中心技术人员交流培训及应用指导;负责单位财务内部审计;负责文明创建、联系群团及驻村帮扶工作;负责大型宣传活动的策划;负责中心对外新闻宣传和信息发布工作。

(三)规划财务科。负责单位年度财务预算、决算的编报;负责年度项目资金预算安排计划的编制、执行和评估;负责固定资产统计;负责会计核算和会计档案管理;负责资金使用情况及相关制度落实情况的反馈。

(四)法制稽查科。负责执法业务培训、执法案件法制审核、执法案卷管理、执法信息统计;统筹负责执法应急管理协调、执法行为内部稽查等工作。

(五)卫生监督执法一科。负责辖区内公共场所卫生的监督管理、执法检查和违法行为查处等工作。

(六)卫生监督执法二科。负责对辖区内医疗机构、母婴保健、人类辅助生殖、中医及其医师、护士执业行为的执法检查和违法行为查处等工作;负责对辖区内采供血机构传染病防治、疫苗管理、生物安全、医疗废物管理的执法检查和违法行为查处等工作。

(七)卫生监督执法三科。负责传染病防治监督;负责对开展放射治疗、核医学、介入放射的医疗机构及其放射工作人员职业健康管理的执法检查和违法行为查处等工作。

(八)卫生监督执法四科。负责辖区内学校卫生、托育机构卫生的监督管理、执法检查和违法行为查处等工作;负责辖区内生活饮用水卫生、消毒产品生产经营、餐具集中消毒等监督管理、执法检查和违法行为查处等工作。

(九)卫生监督执法五科。负责对辖区内存在职业病危害因素的其他用人单位职业病防治工作，职业健康技术服务机构、职业健康检查机构、职业病诊断机构的执法检查和违法行为查处等工作;负责对辖区内具有放射性同位素与射线装置的企业及其放射工作人员职业健康管理的执法检查和违法行为查处等工作。